Nunchaku-jutsu is een door de SNN ontworpen zelfverdediging stijl dat gebruikt maakt van de Nunchaku. Het jutsu is een wat meer realistischere vorm van het gebruik van de Nunchaku.

Bij het jutsu leer je jezelf te verdedigen tegen stokken, messen, zwaarden stoten en trappen. Dit gaat doormiddel van blokken, worpen en controle technieken. Deze technieken hebben vaak Yoseikan Budo als achtergrond en zijn aangepast voor gebruik met de Nunchaku.

Gezien de complexiteit van het onderdeel jutsu wordt het pas bij de eerste dan (zwarte band) geintroduceerd. Bij elke dan komen er nieuwe oefeningen (of kata's) die beheerst moeten worden.